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合成cDNA引物的選擇

日期:2025-05-21 19:11
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摘要: 合成cDNA引物的選擇: 1. 隨機六聚體引物:當特定mRNA由于含有使反轉錄酶終止的序列而難于拷貝其全長序列時,可采用隨機六聚體引物這一不特異的引物來拷貝全長mRNA。用此種方法時,體系中所有RNA分子全部充當了cDNA第1鏈模板,PCR引物在擴增過程中賦予所需要的特異性。通常用此引物合成的cDNA中96%來源于rRNA。 2. Oligo(dT):是一種對mRNA特異的方法。因絕大多數(shù)真核細胞mRNA具有3’端Poly(A+)尾,此引物與其配對,僅mRNA可被轉錄。由于Poly(A+)RNA僅占總RNA的1-4%,故此種引物合成的cDNA比隨機六聚體作為引物和得到...

合成cDNA引物的選擇:

1.  隨機六聚體引物:當特定mRNA由于含有使反轉錄酶終止的序列而難于拷貝其全長序列時,可采用隨機六聚體引物這一不特異的引物來拷貝全長mRNA。用此種方法時,體系中所有RNA分子全部充當了cDNA第1鏈模板,PCR引物在擴增過程中賦予所需要的特異性。通常用此引物合成的cDNA中96%來源于rRNA。

2.  Oligo(dT):是一種對mRNA特異的方法。因絕大多數(shù)真核細胞mRNA具有3’端Poly(A+)尾,此引物與其配對,僅mRNA可被轉錄。由于Poly(A+)RNA僅占總RNA的1-4%,故此種引物合成的cDNA比隨機六聚體作為引物和得到的cDNA在數(shù)量和復雜性方面均要小。

3.  特異性引物:特異的引發(fā)方法是用含目標RNA的互補序列的寡核苷酸作為引物,若PCR反應用二種特異性引物,第1條鏈的合成可由與mRNA 3’端靠近的配對引物起始。用此類引物僅產(chǎn)生所需要的cDNA,導致更為特異的PCR擴增。

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